Republikas pēdējās dienās Zvaigžņu kari Visumam tika dots milzīgs trieciens Spēka gaišajai pusei. Vienā ātrā komandā imperators Palpatīns aktivizēja 66. pavēli. Protokols caur mikroshēmu tika implantēts katram klonu armijas karavīram, un, kad tas bija aktivizēts, piespieda karavīrus izpildīt visus tuvumā esošos jedus. Lielā Jedi tīrīšana likusi mierā lielu skaitu Jedi, un ar viņu nāvi izbeidza visas misijas un noslēpumus, kas vēl bija jāpabeidz.
No visiem šajā liktenīgajā dienā kritušajiem jediem neviens nešķita tik brutāls kā Aayla Secura nāve uz dinamiskas Felucia planētas. Zvaigžņu karu III sērija: Sithu atriebība parāda jauno Tviļeku, kuru nošauj viņas klonu bataljons. Diemžēl, kad viņa nokrita, viņu novērsa putns un tā nespēja reaģēt. Tomēr šāviens kavējas vēl dažas sekundes un parāda, ka kloni turpina šaut uz viņas inerto ķermeni. Viņas briesmīgajai nāvei ir radušies daudzi jautājumi, kad fani mēģina saprast, kāpēc kloni pret viņu šķita tik aukstasinīgi.
Līdzīgi kā viņas meistars Kvinlans Voss, arī Secura izvēlējās iet savu ceļu, ievērojot Jedi ordeni. Tas tika parādīts viņas izvēlētajā apģērbā un veidā, kā viņa ar atpakaļgaitu saķēra savu gaismas zobenu. Secura ļoti rūpējās par savu saimnieku, kurš spēkos bija unikāli spēcīgs. Daudzi teorētiķi uzskata, ka viņa bija arī ārkārtīgi spēcīga Spēkā. Ja tas tā būtu, iespējams, iemesls, kāpēc kloni viņu notrieca, bija nodrošināt, ka viņa neceļas, lai nodarītu lielu kaitējumu savām spējām.
Lielākā daļa Secura piedzīvojumu neliecina, ka Klonu karu laikā viņa izmantoja milzīgu spēku Spēkā. Pat tā ir pilnīgi iespējams, ka viņas spējas vēl nebija pilnībā izpaudušās. Kā alternatīvu, viņas spēkus varēja novirzīt, izmantojot viņas cīņas spējas, kas izmantoja gaismas zobenu cīņas IV un V formu, un tajā bija daudz akrobātikas un uzbrukuma kustību lielā ātrumā.
Vēl viena teorija, kas tika prezentēta, lielā mērā bija saistīta ar Secura attiecībām ar viņas klonu bataljonu. Sakarā ar daudzajiem gadiem, ko džedi pavadīja kopā ar saviem klonu karavīriem, starp abām grupām tika izveidotas daudzas saites. Daži no labākajiem piemēriem ir kapteinis Rekss un Ahsoka Tano vai komandieris Kodijs un Obi-Vans Kenobi. Izmantojot šo loģiku, iespējams, ka kloni ir nepārtraukti apšaudījuši Secura, jo viņi atcerējās vēsturi, ar kuru viņi viņai dalījās, un vēlējās pārliecināties, ka viņas nāve ir ātra un nesāpīga. Ja tas ir taisnība, tas padarītu viņu kā klonu karaspēka pēdējo darbību par vienu no žēlsirdīgākajiem no tīrīšanas.
Aayla Secura bija viens no līdzjūtīgākajiem jediem šajā kārtībā. Tādēļ viņas vardarbīgais gals tika uzskatīts par vienu no brutālākajiem Lielās Jedi tīrīšanas reizēs. Securas nāve ir arī ātrs un ķirurģisks postījums, ko ķeizars bija iecerējis sasniegt. Jedi un pat Anakina Skywalkera nogalināšana prasa daudz Fantoma draudi neticēja, ka ir iespējams visus uzvarēt. Tomēr imperators pierādīja, ka viņš ir kļūdījies, vienā mirklī iznīcinot gandrīz katru no viņiem.
Gandrīz katra jedija nāve iestājās ātri un vardarbīgi. Pasākuma laikā dažas no pēdējām izjūtām, kuras izdzīvoja Spēka lietotāji, bija nodevība un sāpes. Pat Secura nāve sasniedza Jodu, kura tajā laikā atradās uz pavisam citas planētas. Precīzs iemesls, kāpēc kloni tik daudz reižu apšaudīja Secura, joprojām ir noslēpums. Neskatoties uz to, šī noslēpums ir ļāvis faniem pulcēties, atkal spekulējot par daudziem citiem Zvaigžņu karu Visuma noslēpumiem.
